摘要：為探究微衛(wèi)星在黏孢子蟲全基因組中的作用及其在遺傳研究中的潛在應(yīng)用價(jià)值,研究在對(duì)“鯔麻風(fēng)病”病原鱗上碘泡蟲進(jìn)行全基因組測(cè)序的基礎(chǔ)上,采用生物信息學(xué)方法分析了其微衛(wèi)星分布特征和規(guī)律。通過(guò)對(duì)基因組完整型微衛(wèi)星的篩選,共得到21957個(gè)完整型微衛(wèi)星,總長(zhǎng)311751 bp,在全基因組中占0.3%。在6種微衛(wèi)星重復(fù)類型中,單堿基重復(fù)類型的微衛(wèi)星數(shù)量最多,占42.5%,其次是二堿基(26.0%)、三堿基(17.9%)、四堿基(12.5%)、五堿基(0.8%)和六堿基(0.4%)。得到位于外顯子區(qū)的微衛(wèi)星93個(gè),分別定位于39個(gè)基因。GO注釋結(jié)果顯示,基因中涉及到生物過(guò)程的基因數(shù)量最多,其中最顯著的條目是胞內(nèi)細(xì)胞器組分。KEGG富集結(jié)果顯示,基因共涉及到80條通路,其中集合管酸分泌物通路最為顯著。GO注釋和KEGG富集分析結(jié)果表明,鱗上碘泡蟲含有微衛(wèi)星的外顯子可能與體內(nèi)生物代謝過(guò)程密切相關(guān)。研究獲得了黏孢子蟲微衛(wèi)星分布特征及規(guī)律方面的基礎(chǔ)數(shù)據(jù),將為黏孢子蟲微衛(wèi)星分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)、遺傳分析和病害防治提供參考。
