摘要：為探究中華鱘(Acipenser sinensis)皮膚黏膜層微生物菌群結(jié)構(gòu)和其骨板褪色癥之間的關(guān)系,本研究通過Illumina高通量測序,分析健康和患病中華鱘背骨板皮膚、軀干部皮膚微生物菌群結(jié)構(gòu)特征。結(jié)果顯示:4種來源皮膚黏膜層共有3406個OTU。與健康組相比,疾病組背骨板皮膚OTUs數(shù)量下降84%,軀干部皮膚OTUs數(shù)量下降55%。在門分類水平,健康組背骨板皮膚和軀干部皮膚的優(yōu)勢菌門組成較為相似,均以變形菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)和擬桿菌門(Bacteroidetes)為主,三者占比超過75%;擬桿菌門在疾病組背骨板皮膚和軀干部皮膚高度富集,前者相對豐度由11.15%升高至67.99%,后者相對豐度由20.28%升高至53.48%。在屬分類水平,黃桿菌屬(Flavobacterium)在疾病組背骨板皮膚和軀干部皮膚中相對豐度分別為42.83%和21.78%,均高于健康組樣品(4.20%和16.92%);金黃桿菌屬(Chryseobacterium)在疾病組背骨板皮膚和軀干部皮膚中相對豐度分別為23.34%和27.65%,均高于健康組樣品(0.33%和2.16%)。多樣性分析顯示,健康組和疾病組皮膚黏膜層之間的Chao指數(shù)和Shannon指數(shù)具有顯著差異(P<0.01)。顯著性差異分析顯示,黃桿菌屬、金黃桿菌屬、食酸菌屬(Acidovorax)和氫噬胞菌屬(Hydrogenophaga) 4個菌屬在疾病組中顯著上調(diào)(P<0.05)。本研究表明,與健康組相比,疾病組中華鱘背骨板皮膚和軀干部皮膚OTUs數(shù)量均明顯降低,豐富度和多樣性均顯著下降(P<0.01)。擬桿菌門的黃桿菌屬和金黃桿菌屬在疾病組皮膚黏膜層高度富集,可能是此次疾病的主要致病菌。
